Estudo comparativo entre estereologia e análise de imagem para quantificação rápida e precisa em patologia experimental

  • Maria Razões Faculdade de Medicina Veterinária- Universidade Lusófona, Centro Universitário de Lisboa
  • David Ramilo Centro de Investigação Veterinária e Animal (CECAV), Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Lusófona, Centro Universitário de Lisboa, Portugal.
  • André Pereira Centro de Investigação Veterinária e Animal (CECAV), Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Lusófona, Centro Universitário de Lisboa, Portugal.
  • Patrícia Rodrigues Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal
  • Pedro Faísca Centro de Investigação Veterinária e Animal (CECAV), Faculdade de Medicina Veterinária, Universidade Lusófona, Centro Universitário de Lisboa, Portugal. http://orcid.org/0000-0002-3922-3602

Resumo

Objetivos: A análise de imagem representa um avanço na avaliação quantitativa em patologia, proporcionando métodos mais rápidos e reprodutíveis. Os programas de código aberto, como o Qupath, democratizam a utilização destas ferramentas, mas a sua precisão e exatidão podem variar, e inferir estruturas tridimensionais a partir de estruturas bidimensionais pode induzir em erro. Este estudo combinou a estereologia, considerado o método de referência com análise de imagem, para criar uma abordagem tão precisa quanto a estereologia e tão rápida quanto a análise de imagem.

Material e Métodos: Foram utilizados 5 camundongos com melanoma pulmonar metastático e 5 com fibrose cardíaca. Cada órgão foi seccionado de forma sistemática e uniforme gerando 8-10 cortes por órgão. Para a quantificação por estereologia utilizou-se o programa Visiopharm. Para a quantificação por análise de imagem, usou-se o programa Qupath, utilizando o algoritmo threshold para as metástases pulmonares, e o método de machine learning para a fibrose cardíaca.

Resultados: Não foram identificadas diferenças estatisticamente significativas (p>0,05) entre os métodos para volumes pulmonares, metástase e % metástase/pulmão, com coeficiente de correlação forte (r=0,9; p=0,083). Para volumes de coração, fibrose e % fibrose/coração, também não foram observadas diferenças estatisticamente significativas (p>0,05), com coeficiente de correlação muito forte (r=0,999; p<0,001). Ao comparar as % de metástases/pulmão e fibrose/coração entre lâminas individuais no mesmo animal, foram encontrados vários animais com lâminas com valores discrepantes, com coeficientes de variação superiores a 10% e, em alguns casos, ultrapassando 40% e 60%, respetivamente, indicando heterogeneidade moderada a forte.

Conclusão: Os algoritmos descritos oferecem uma alternativa confiável e acessível para análise histopatológica automatizada, com estimativas de volume altamente precisas, reprodutíveis e comparáveis à estereologia. Além disso, o estudo confirma a inadequação de confiar apenas em uma única seção 2D para representar com precisão uma estrutura 3D.

Palavras-chave: Patologia digital, Análise de imagem, QuPath, Inteligência artificial, Machine learning.

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Publicado
2024-12-27